這個理論的意思就是說，在生物界的進化中，所有生物都必須不停的跟身邊其他物種相互競爭，一旦進化中止，那麼這個物種會毫不留情的被淘汰掉。
整個進化過程可以用一句“逆水行舟不進則退”來形容，歪果仁是不知道這句話的，但是在《愛麗絲漫遊仙境》的故事裏，紅皇后對愛麗絲說過這麼一句話：“在這個世界裏，你必須不停的跑，才能使自己不停在原地。”
所以，科學家將這個命名爲紅皇后理論。
而到了進化層面，就不得不提病毒了。
上世紀90年代，生物測序技術已經比較成熟，科學家開始研究人類染色體中核苷酸序列，以破譯人類遺傳密碼中的祕密。
研究人員發現，人類的基因組中大約有8%的結構確認是由曾經侵襲我們祖先的病毒構成，還有40結構疑似是由侵襲我們祖先的病毒構成。
簡單來說，病毒就像是一種主要由核酸構成的機器人，在攻擊人類的時候，它會像寄生蟲一樣將自己嵌入人類細胞的核苷酸鏈，然後偷偷將細胞的核酸拆下來製作成和自己相同的模樣，來複制大量的自己。
不過在複製時，它卻又很容易將自己的一部分留在人類的dna鏈條上，例如胎盤的產生，就是一種病毒感染的結果，這種病毒能合成合胞素，哺乳動物在感染這種病毒後纔出現了胎生的現象。
這些病毒被稱爲“內源性逆轉錄病毒”，它們中的一些甚至是人類歷史上最重要的敵人，卻成爲人類進化至今不可缺少的一部分。
因此，通過一種病毒讓人類產生進化，是一件很正常的事情。
此時陳晨便一邊對照蜂巢內破解出的始祖病毒的資料，一邊解析着be-006病毒。
通過蜂巢實驗室內各種高尖端設備，以及x-112的智能，be-006的基因幾乎是以一種現實世界無法理解的速度被一點點檢測出各項用途。
be-006的基因序列中有着1467個基因，50個基因編碼，雖然憑x-112的計算能力結合實驗室中的機器解讀極快，可依然需要好幾天的時間。
於是，陳晨乾脆讓剩餘那名黑騎士駐守在通道前，守住後路，而陳晨則順着鐵軌準備去地面上看看。
電車行駛的這條通道並不遙遠，只有五公里左右，陳晨不到一個小時便走到了盡頭。
盡頭處是一臺滿是抓痕的電車，以及一座封死的大門。
“x-112，給我開門。”
陳晨用無線電通訊設備給如今掌控蜂巢的x-112說了一句話，頓時，那座大門緩緩上升起來。
陳晨還記得，電影第一部的結尾，便是愛麗絲和馬修兩人坐着電車逃了出來，在逃離的途中還遭到了舔食者的攻擊。
不過最終兩人還是幹掉了舔食者，同時關閉了蜂巢的大門，只是纔剛脫離虎口，卻再次被保護傘的人員抓住，而保護傘則又一次打開了大門，讓喪屍蔓延到了浣熊市。
隨着大門徹底開啓，原本黑暗的通道終於被一道光芒穿透，照射進來。
陳晨眯起眼睛，伸手擋住光線，這才發現，大門外的建築似乎已經坍塌了。
這裏，是生化危機開始的地方：洋館別墅。
無盡的雜草幾乎有半人高，大量爬山虎植物包裹了整個廢墟，將這裏變成一片綠色的荒原。
陳晨在這裏隨便搜索了一下，不過除了幾具早已腐爛得看不出來的屍體，除此之外便是一望無際的綠色。
陳晨走出廢墟，立即看到遠方一座座殘垣斷壁，那裏便是浣熊市，一個受到了五千噸當量核電打擊的小城市。
五千噸當量嚴格來說並不大，如今來看，這枚核彈在半空中空爆之後，削平了方圓五平方公里內的建築，除此之外，便是在浣熊市的城中心留下了一座直徑約一公里的圓形彈坑。
不過還好當量不大，因此位於市中心地底三百米深的蜂巢承受住了這次襲擊，並沒有受到太大的影響。
除此之外，陳晨並沒有看到任何喪屍，也沒有看到任何人跡。
在浣熊市附近轉了一圈，陳晨沒有找到任何有價值的東西，很顯然當然那場爆炸銷燬了浣熊市，也銷燬了這裏幾乎所有的喪屍。
而一些僥倖活下來的喪屍，也因爲沒有能源和水分補充，只能自行消解了。
陳晨走進郊區一家還算完好的房屋中，只看到無數藤蔓植物肆意蔓延進來，甚至連房間內部都爬滿了植物，除此之外，地面上還倒着的幾具早已腐爛完的屍體。
這些屍體都成了骷髏，也看不出他們生前到底是人類還是喪屍。
略微轉了一圈，眼看快要入夜，陳晨出於謹慎便返回了蜂巢，重新讓x-112關閉了大門，將這裏封死起來。
想要探索這片世界，以後有的是時間，卻不是現在。
陳晨還有自己此次的重要任務。
接下來的兩天，陳晨不再外出，而是查閱着蜂巢內一切有關生物學方面的資料，這些資料給了陳晨很大的啓發。
直至兩天後，在陳晨快要將帶來的食物喫完時，對於be-006病毒基因的解析終於完成了。
在解析出be-006每條鹼基對的作用後，接下來就再簡單不過，只要使用腺嘌呤鹼基編輯器，將be-006病毒相應的基因進行編輯，將be-006改造成一種不具有傳染性，不具有毒性的病毒就夠了。
這是一種通過基因編輯工程獲得的新病毒，它和原本的be-006相差無幾，同時也是一種疫苗。
將這種新的病毒植入人體後，因爲沒有毒性，因此人體有足夠的時間生成抗體，只要能產生出抗體，那麼人體自然就可以對be-006進行免疫。
這種方式是通過對be-006基因認知達成的，難點除了能解析病毒的所有基因外，還必須有能精確對基因進行編輯的能力。
只有兩樣都符合要求，才能編輯出陳晨需要的病毒來。
現實中的生物技術想要達到這種程度十分困難，甚至比病毒蛋白疫苗的製造更加困難，唯有生化危機位面才能輕易做到這種程度。
陳晨來對了。