評議部開會時往有激烈的辯論，有時到點名熄燈時方纔散會，說明大家對執行這個制度是很認真的。
兩江總督端方每月撥銀1000兩，派四品京堂鄭孝胥爲監督。學校有了官派的監督，民主的政體便發生了障礙，執行部久不改選，評議部也有度止的危險。
兩江總督端方，其實是個新派人物。戊戌變法中，朝廷下詔籌辦農工商總局，端方被任命爲督辦。他全身心的投入到新籌辦的部門當中，他曾一天連上三折，其工作熱情與效率，可見一斑。
升任湖北巡撫不久，隨即辦起了六十餘所新式學堂並派出大批的留學生（其子也赴美國留學）。
光緒三十年（1904年），代任兩江總督創建暨南大學。之後，他調任湖南巡撫。半年內便建有小學堂八十多所。據說，端方在調任江蘇巡撫時，上任伊始便革除了各州縣例送紅包給新任巡撫大人的陋習，並用紅包的錢選派兩名學生出國留學，一時傳爲美談。
在歷任上述封疆大吏期間，端方鼓勵學子出洋留學，被譽爲開明人士，“奮發有爲，於內政外交尤有心得”。
中國公學簡直就是個革命黨人的培訓學校，能夠爲這樣的學校每月撥銀1000兩，是很能說明問題的。可惜，這樣一個開明之人，最後還是死於革命黨人之手，不能不令人惋惜。
胡適寫到：“到了申之秋，評議部與職員發生激烈的衝突，結果致絕大多數學生整隊退學，自行組織中國新公學，仍繼實行民主政治，支持至一年餘始解散。這三年多的維形民主國，在中國政治革命上是很可紀念的。＂
1952年12月23日，胡適在中國公學校友會歡迎會上講話中，又強調了中國公學當年的共和民主的政體在教育上的試驗意義，他說：“中國公學和中國教育制度以至民主的政治制度，也有很深切的關係。當時我們母校的教育制度，有着一點獨持的作風，這種作風便是民主制度在教育上的試驗，當時校內並不設校長，而三位幹事共同負責處理校務，成爲學校行政機關。另外由全體同學推舉班長、室長，實行自治，並且選舉評議員，組織評議會，成爲學校的立法機關。一切校務雖由幹事部負責執行，但必須先經評議會通過，完成立法程序。”
後來當過中國公學副校長的亮功至把這種“學生治校”的制度，和歐洲中世紀大學創始時的制度作了比較，充分肯定了它在中國教育史上的創新意義。
中國公學實行的這種高度民主自治的管理制度，自然受到廣大革命熱情高漲的同學的歡迎與擁護。但從實際出發，它在中國這塊土壤上，顯然缺乏充分持久發育的外部條件。
一、學校內留日學生逐漸減少(部分又回日本復課了)，而新招的學生逐漸增加，已不是當初發起創學時學生與管理彼此不分界限的情形。
二、當時上海社會和官方，對這種辦學制度的忌疑與不滿日益增大，缺少社會尤其教育界人士的理解與同情。
三、學校沒有兩江總督端方的官費資助便辦不下去，而接受了官方的資助，便無法抗拒官方在管理制度上插手學校。
最初創立時不設校長，幹事部的幹事分任教務、度務、商務，後來推鄭孝胥爲校長，聘馬君武爲總教習。馬君武赴國外留學後，總教習之職便度止。公學受兩江總督的津貼之後，校長改爲監督。第一任監督是鄭孝胥，第二任爲夏敬觀，同時成立了鄭孝胥、張賽、熊希齡等幾十人參加的校董事會，推舉張賽爲會長。在董事會制與監督制的雙重壓迫下，學生自治的民主政體開始瓦解。
儘管鄭孝胥、夏敬觀這一些社會名流忙於詩壇和文壇，對校務毫無興趣，但公學的民主政體已經受到嚴重壓抑。原來公選的幹事改爲由學校聘任的教務長、庶務長、齋務長，而且新校章取消了評議部這個以學生爲主體的“立法機關”。這就激起了廣大同學的強烈不滿。他們抓住校章上“非經全體三分之二承認，不得修改”的“法”條文向校方表示抗議，認爲三位幹事自修改校章是非法的，取消評議部也是非法的。
爲此，全體同學就組織了一個“校友會”，類似於現在的學生會組織。校友會與三位幹事爭議了幾個月，終於達成了由全體學生修改校章的協議。又費了幾個月，開了許多會，校友會把修正意見整理出了一個草案，議定一本新校章。誰知校章草案遞上去後，監督與董事均不承認，於是雙方的情緒衝突便不可避免。“修憲”成了這次大風潮的導.火.索。
190年舊曆九月三日，校友會召集大會，向全體學生報告關於新校章交涉的經過。大會未散，監督貼出了佈告，完全否認學生有改訂校章之權，把先前三幹事與全體學生達成的協議撕段了。緊接着又出了兩道佈告，一道是“集會演說，學堂懸爲萬禁，……校友會以後不準再行開會”。
從中國公學分立出去的新公學，同學們頂住了一切困難，一心一意要把新公學辦成一所教員好、功課緊、管理嚴的好學堂。
因缺少教員，新公學的教務千事李琴鶴要求胡適擔任低年級各班的英文教員，他深信胡適當時的英文程度足可以當一名合格的英文教員。條件是：每週三十小時課，月薪十元。因爲是自家同學當教員，薪水不能領全額，需得拖欠一部分。
胡適答應了，原因很簡單，他的困窘的經濟狀況不允許他繼續求學。聘爲教員的被信任感與榮譽感使他感到欣悅，而巨大的責任感，又使他一開始，就十分認真而熱情地面對自己的這個全新崗位。那時他還不足十七週歲。
胡適當了一年新公學的英文教員，每天上課六小時，還要批改作文卷子。胡適教書生涯的第一批桃李中，出了幾位相當有名氣的人物，如饒毓泰、楊杏佛、嚴莊、張奚若等，他爲有這樣的優秀學生而感到自豪，也爲自已沒有誤人子弟而感到欣慰。