但是，當中國軍隊在路上時，日本的先頭部隊四百人已經先期到達。
爲了遮人耳目，對外聲稱這四百人是護送駐朝公使大鳥圭介回朝赴任，並保護日本公使館免遭起義軍攻擊。
這樣不同尋常的興師動衆，引起了高宗李熙的驚慌，立找袁世凱討主意。
日本方給袁世凱的通知是大鳥圭介只帶二十名巡捕回任。
事情都已經明瞭，袁世凱不出去覈實，仍一味的相信大鳥圭介。回覆李熙：大鳥圭介不喜歡多事，只帶二十名巡捕，自無打仗之意。
六月六日，中國按事先約定，告知日本中國出兵朝鮮。
六月七日，日本答覆中國，不承認朝鮮爲中國屬邦。正式通知，日本軍隊已經進入朝鮮。
然後威脅李熙，不能同意中國軍隊來朝鮮，以防擦槍走火，把朝鮮變成中日的戰場。
李熙驚恐萬分，連忙告知袁世凱。通知中方，清軍到達後不要上岸，也不要再增兵。
袁世凱不做理會，答覆李熙：“日本出兵，朝鮮應當力加阻止。如無力阻止，中國也要調兵躡防。”中國沒有不出兵的道理，是不是進兵朝鮮？“惟視全匪存亡，不能因倭調兵遽停進”。
到了這個時候，袁世凱還對日本出兵朝鮮的嚴峻形勢缺乏應有的重視。
六月八日，大批日軍隊開進朝鮮，袁世凱此時纔看到大事不妙。
馬上致電李鴻章：“倭來甚銳，似非有得，不肯遽去。”
但他還對日本存有最後的幻想，安慰李熙：說日本出兵意在“與華爭體面，兵來非戰，且勿驚極”，堅持認爲“欲速退倭兵，唯有速圖剿匪”，這樣就可以使日本失去駐軍朝鮮的藉口。
而此時，東.學.黨.起義人員，已退出全州，日本人還在繼續開進朝鮮不止。
日本看到自己的目標已達成，軍事部署已近完成，正式和中國攤牌。告之中國，日本軍隊進入朝鮮與否，進入朝鮮多少人，中國無權干涉。
清**爲避免和日本發生衝突，提出兩國同時從朝鮮退兵，日本根本不理。
爲了阻止日本繼續的進兵朝鮮，袁世凱敦促朝鮮**與日本交涉，同時請各國公使出面干預。
大鳥圭介在各國公使的壓力下，不得不坐到談判桌前。
經過談判，雙方約定不再增兵。大鳥圭介說一套做一套，繼續增兵不止。
而袁世凱卻信以爲真，電告李鴻章不要增兵。
這樣一來，二國在朝鮮的兵力越發懸殊。
當東.學.黨.起義已經完全被鎮壓，清**以朝鮮亂局已平定，要求中日按原約定同時撤兵，但日本根本不加理會。
袁世凱終於看出了日本的真正企圖，是想處心積慮的挑起中日衝突，把中國趕出朝鮮。這時才和李鴻章說實情，宣稱局勢有多嚴重，請求大舉增兵。
幸虧有這份電報，否則，袁世凱是會很麻煩的。別說是官位，弄不好腦袋都保不住。關於這一點，我們以後會知道的。
面對這樣的局面，李鴻章不會不知，出兵朝鮮已不是小打小鬧，而是和日本之間的一場大仗；甚至是二國的全面戰爭。這對於中國來說，有沒有能力？在不在李鴻章的權力範圍之內，先另當別論？最根本的是自己這邊還沒有任何準備呀！
也就是說，由於袁世凱地自以爲是及其提供的虛假信息，機會已經錯過了。
日本控制朝鮮後，做的第一件事，就是要求李熙對外宣佈：朝鮮是完全獨立的國家，和任何國家都沒有所謂的宗藩之類的關係。
也就是把朝鮮問題和中國徹底脫勾，日本在朝鮮幹什麼？都與中國沒有關係。
李熙不知如何是好？找袁世凱商議。
袁世凱現在不敢輕易自作主張了，發電請示李鴻章。
李鴻章也束手無策，不知如何是好？
袁世凱沒有辦法，只能指示李熙拒絕日本的無理要求，而且一再要求李熙堅決頂住日本的壓力。
李熙除了對日本的要求一切照辦外，還能有別的選擇嗎？
袁世凱這個時候，不但不檢討自己的失誤和無能，反而把責任都推到李熙身上。說他是：目無上國，冒天下之大不違。
這個時候，我們可以看到，袁世凱身上又沾染了一個官場官員的惡習：出了問題，從不在自己身上找原因，找不足。即便完全是他自己的原因，也要想法設法的甩鍋，把責任搞到別人頭上，或者爲自己找到辯護的理由和原因。
像袁世凱這一類的某些居於高位之人，用人們常說的一句話是：永遠正確，總是有理。
在他們看來，他們怎麼可能有錯呢？他們怎麼可能犯錯呢？如果他們有錯，如果他們犯錯，世人還能尊重他們嗎？還能還拿他們當回事嗎？不是要威信掃地嗎？那還了得？
其實，他們錯了。那些真正品格高尚的政治家，人羣中那些胸懷坦蕩的首領級的人物，他們的高風亮節恰恰在於他們總是善於和不斷的查找自己的不足，找尋自己的毛病。
而更可貴的是他們能夠公開承認自己的錯誤，公開說出自己的毛病和不足。而正是這樣的人，反而會得到世人更強烈的擁護和尊重。而且，這擁護和尊重是發自內心的。
而事實上，他們也肯定會把事情辦得更好。因爲，人總是要在克服不足中前進的，因爲，失敗是成功之母。
但是，袁世凱怎麼能懂這些呢？用這樣的高尚的人品要求袁世凱這樣的人，不是太難爲他了嗎？
看到朝的形勢已經無法挽回，而且越來越惡化，再留到朝鮮，不但不會有什麼業績，而只能是背越來越多的黑鍋。袁世凱知道自己不能在朝鮮待下去了，必須想辦法離開。
這時，他聽到消息，大鳥圭介正準備派兵把他押解出境。
這是可能的，因爲日本一直把袁世凱視做眼中釘肉中刺。
如果真的被武裝押送處境，不但他自己的顏面掃地，國家也會顏面無存。這下子他找到開溜的理由，於是接連給李鴻章發了兩封急電。
其一曰：“聞韓決意不從屬，是無上國。凱華員，須詰勸韓，轉告大鳥。聞鳥擬照公法作梗例，兵押凱出。果爾，辱甚。只可照萬國使例，送文知照韓，回國稟商，請兵伐韓。”
其二雲：“聞倭兵八百今駐赴牙路，意叵測，倭韓相結，我兵可危。又俄，法署使來稱，韓廷犒賞倭兵米肉甚多，韓喜倭，殊不可解。華人在此甚辱，凱在此甚難見如，應下旗回，擬留唐（唐紹儀）守看館探事。”
李鴻章顯然認爲袁世凱是小題大做，草木皆兵。回電：朝鮮尚未公開承認不是中國屬邦，應留下密勸朝鮮堅持；俄國公使已經答應出面調處，必有收場。“倭允不先與華開釁，豈能拘送使臣？勿怯退。”
這個時候，李鴻章還不知道袁世凱在朝鮮已如喪家之犬，惶惶不可終日。以爲他還有很大能量，還指望袁世凱能利用他的影響力，使朝鮮的形勢不至於太糟。
這也難怪，誰讓袁世凱此前一直閉着眼睛說瞎話了。
所謂，吹牛雖然不用交稅，但可能給自己找麻煩。
李鴻章回電，雖然沒有訓斥袁世凱，但一句“勿怯退”，已經很難聽了，袁世凱能聽不出來嗎？但是，他已經顧不得許多了。
很快又給自己開溜找到了藉口：“倭兵萬人，分守漢城四路各要害及我陸兵路，均置炮埋雷。……觀其舉動，不但無撤兵息事意，擬將有大兵續至。倭蓄謀已久，志甚奢，倘俄、英以力勒令，或可聽；如只是調處，恐無益，徒誤軍機。……葉（葉志超）君居牙，難接濟，倭再加兵，顯露無忌。應迅派兵商船全載往鴨綠或平壤下，以待大舉。韓既報匪平，我先撤亦無損；且津約倭已違，我應自行，。若以牙軍與倭續來兵相持，釁端一成，即無歸路。”
袁世凱說了這麼多，說到底還是請求同意他離開。