而護國軍軍方面，由於兵力和財力等方面的限制，想取得大的突破也很難。
在一片厭戰的聲浪中，蔡鍔等人開始把戰略重點轉向了爭取陳宦和四川獨立上。既能減少流血，又能取得更大的收效，這當然是最好的事。
其實，在交戰的過程中，雙方也有私下的聯絡和溝通。
除了陳宦和蔡鍔有信使互通外，馮玉祥也曾先後兩次派人和蔡鍔接頭，表示決心響應起義，願意聯絡在四川的北洋軍採取一致行動。他是在內心深處反對袁世凱稱帝的，曾對外表示：如果坐視袁世凱稱帝，當初爲什麼要參加推翻清廷爭取共和的起義？
蔡鍔想得更長遠，和馮玉祥講，如果能勸說陳宦宣佈獨立，對護國大業貢獻更大，馮表示他一定會盡力。
張敬堯也有信給蔡，申述個人的主張，表示決不爲項城一人爭總統。蔡希望他能宣佈獨立，用行動來證明。他回答說要集合各軍代表在瀘州舉行一次會議，以求一致。
陳宦接到袁世凱的停戰要求後，正求之不得，隨即向蔡鍔發出停戰書：
“雲南此次起事，全國皆知，原由愛國起見，並無絲毫個人惡感。茲者帝制經已取消，公等目的亦已達到，而大局尚岌岌不可終日，凡以國事爲前提者，即當設法維持。蔡公愛國達士，想亦與表同意。茲請通示前敵，暫行停戰，以便雙方討論善後辦法。敝處亦當分示北軍長官，立即停戰。素仰我公大公無私，諒能不趨於個人感情作用，有以教我。其餘詳細辦法，已面囑敝處代表，親赴臺前，面述一切。”
蔡鍔復陳宦書：
“敬誦大函，得領宏教，不勝欽佩。所云此次雲南起事，特爲護國起見，誠然誠然。當時鍔等以爲起事之後，可用軍事上之態度，表示國人反對帝制之意。如袁氏而良心不昧，即當俯從民意，中止帝制行動。詎料袁氏並無悔禍之心，竟又調派大軍南下，以實行武力壓制。以爲如此，則真正之民意，可以被其壓倒，而帝制可成功。因此致令生民塗炭，將士喪亡，舉國騷然，四民失業。袁氏豈能辭其咎耶！及見人民反對日烈，帝制終無成功之望，始不得已勉行取消。論者以爲袁氏至此必能退位以讓賢者，乃復尸位不去，此非吾人所能解者。
“試問袁氏居此失敗地步，能否掌執國家大權，操縱如意。即使能之，又試問袁氏尚有何面目以見國人。今姑將道德廉恥暫置勿論，又試問當此紀綱法律、對內對外之威信，蕩然掃地之秋，袁氏焉能舉國中之有才有德者以供其指揮耶？袁氏獨行五年於此，試問成效何在？據吾人所聞，袁氏屢次佈告國人，自謂當初不欲再入政界，因辛亥時迫於公義，國人之請，不得已始出肩任國家大事，以盡愛國愛民之苦衷。
“茲者舉國國民，同聲要求袁氏退位，爲袁氏計，亦只有自行卸職之一途，始不與其所謂愛國愛民之宗旨相牴觸。否則帝制今雖取消，焉知將來不死灰復燃。請問我公果有何等擔保足以取信國人耶？或者以爲袁氏退位，不免有新發生之競爭，致使國家趨於危境。鍔則以爲大謬不然。袁氏果能退位，繼位問題不當以武力解決，應以法律解決之。《約法》不雲耶，若遇總統退位，則其責任職權，當以副總統繼續肩任。袁氏果去，則黎副總統照法律上應繼其後。同時應按《約法》，召集國會，另行選擇正式總統，當不至生若何紛爭也。”
“急。永寧畢節探送蔡將軍、雲南唐將軍、南寧陸將軍、貴陽劉護軍使鑑：頃帝制發生，實非元首本意。當日羣言蜂起，元首尚認爲不合時宜。乃中外有力之人，羣相推戴。諸公亦同在贊成之列，勉強承認，並未正位。滇省發難，致動干戈，元首既有罪己之文，吾輩亦負罔上之責，即諸君以爲共和不宜改變，初亦可直言無隱，弭患無形，迨事發而舒之以兵，已傷國家元氣。大總統不忍生民之禍，且深體諸君維護共和之忱，下令撤銷，痛自引咎。
“在諸君目的已達，帝制永無復活之期。而外顧大勢，內顧民生，漁利紛乘，哀鴻遍野，鬩牆禦侮，正在此時。若以愛國始，而以禍國終，諸君明達，當不其然。務望諸君罷兵息民，恢復原氣，則中外輿論，亦以爲諸君大公元我，確有誠意捐除成見，自感召天和。若於撤銷帝制之後，逞忿不已，相持太急，禍及同根，則非特擁護共和之功不能建，恐亡國之禍亦將隨之。辛亥以還，八方雲擾，危者復安，伊誰之力？此是平心之論，非阿好之言。禹、湯聖人，不免罪己。諸君寧不念國際地位，人民慘狀，而忍忘同舟共濟之義，蹈抱薪救火之譏乎？倘必張脈僨興，不爲平情酌理，則瘠牛憤豚，惟力是視。爲叢驅雀，爲虎作倀，諸君又何利焉？國之存亡，匹夫有責，轉禍爲福在諸君一念之間耳！柄勢不可再淪，民心不可再渙，唯諸君實圖利之！政事堂統率辦事處。”
蔡鍔復北京政事堂電：
“帝制撤銷後，二庵派員持條件來商，首言仍戴袁項城爲總統，再以他條防微杜漸，冀可從速弭禍，維持調護，深佩苦衷。國勢至此，若可以寧人息事，萬不忍再滋紛擾。耿耿此心，盡人而同。惟茲事體大，有應從長計議者。以法理言，項城承認帝位時已有辭退總統之明令，是國會選舉之效力，已無存在。此時繼續舊職，直無根據。世豈有未經選舉之總統，此而囫圇吞過，尚覆成何國家？以情勢言，項城身爲總統，不能自克，及承認帝位，又不能自堅。一人之身，數月之間而號令三擅，將威信之謂何？此後仍爲總統，縱使指天誓日，亦無以堅人民之信。則種種防閒之要求，自爲理所應有。上下相疑，如防盜賊，體統何在？政令難行，此徵諸內情而決其不可者也。……故以二庵條件，分頭電商滇、黔、桂、粵各省，皆嚴詞峻拒。海內外名流函電紛馳，語尤激憤。人心如此，項城尚何所戀乎？
“今有識者，皆謂項城宜退，遵照《約法》，由副總統暫攝，再召國會，依法改選。此時更公推東海（徐世昌）、芝老（段祺瑞）、華老（馮國璋）分任樞要各職，於法理事勢，兩無違礙。計今日大事所賴於項城者，黃陂、東海、芝老、華老諸公亦優爲之，其致疑於項城者，黃陂諸公舉皆無有。是項城退，萬難都解。速弭禍亂之法，更無逾於此者。人生幾何？六十老翁以退而安天下，尚復何求。緬懷讓德，常留國人不盡之思。追念前功，猶爲民國不祧之祖！若復着戀不決，坐待國人盡情之請，彼時引退，則逼迫強制，終累盛德。不退則再動干戈，又爲戎首。二者必居一。於此爲國家計，爲項城計，並懇諸公合詞規諫，勿昧先機。鍔於項城多感知愛，惓惓忠言，蓋 上爲天下計，亦下以報其私。惟諸公鑑察。”