姚泓歸降，少了許多傷亡，楊安玄無意誅殺這位降太子，是死是活看建康處置。
將首級、玉璽、重器以及包括姚泓在內的秦國宗室百餘人，捎帶上樑喜、竇溫等重臣一股腦裝上戰船，讓劉衷通過水路將他們運往建康城報捷。
接下來處理俘兵，抓獲大夏俘兵八千四百餘人，長安城秦國降軍近兩萬人，這些人暫時關押在城南的軍營中，若不及時處理這些人將是隱患。
將大夏軍和秦國軍隊打散分成兩部，楊安玄命楊思平、趙田各率三千精兵、八千屯軍押運這些俘兵前往上洛和弘農安置。
這些俘兵多是青壯，這些人若能順利充實到雍、司之地，能讓治下實力大增。但要這些人背井離鄉，路上可能發生意外，楊安玄暗示兩人，若有俘兵作亂，不妨殺之。
緊接着楊安玄將宮殿以及書籍封存好，宮中僅留少許內侍、宮女維護，其他人遷出宮外。楊安玄把從宮中得到的珍寶賞賜給出徵將士，許諾將宮中所得女子賞賜給有功將士，。
要安撫百姓，當務之急是賑濟災民。賑災糧不足，楊安玄讓趙田帶了張鋒、沈慶之查抄秦國王公貴戚的府邸，抄這些人的家秦國百姓只會拍手稱快，有利於安定民心。
有人捨命不捨財，試着憑家世講講道理，結果用人頭造就出晉軍的兇殘，讓秦國王公大臣對亡國有了深刻的理解。
爲防止兵馬四處搶掠，楊安玄在諮議殿召集麾下文武以及秦國降官約法三章，不準隨意搶掠，不得侮辱婦女，不可妄殺無辜，違犯者斬。
楊安玄將得到的後秦國土暫劃爲北雍州，以王鎮惡爲刺史，主持軍政事務；陰績爲州別駕、岑明虎爲州治中、蒯恩爲州司馬；又命秦國降臣趙琨爲京兆尹，讓他安撫長安城中士族百姓，組織補種、補耕。
根據黃富提供的名單，任用了一批暗中向晉軍投誠的秦國官員，這批新貴多是熟人，見面後方知對方早已向晉軍投誠。
這批人原本處於秦國的低層，上位後爲了表現出自己的價值，做事賣力，唯恐被人取代，對待曾經的上司、同僚分外嚴苛，楊安玄藉助他們迅速地穩定住官場政體。
待局面控制住後，楊安玄留下兩萬兵馬歸王鎮惡統轄，將蒯恩、岑明虎、陰績、周超、馮衡等人留在其麾下，自己與朱齡石、張鋒、沈慶之等人帶了兩萬四千兵馬出城駐紮在南門軍營中。
長安城內有人不堪國破家亡的慘狀，飲藥、懸樑、投井而死，哀泣之聲時現。對於另一些人來說新主到來意味着新的機會，歌功頌德有之，敬獻祥瑞有之，進貢美女珍寶有之。
城門處發放的賑災粥倒是不限量，性命無憂，普通百姓可不管城頭變幻了大王旗。
廣平公府被改爲刺史府，每天前來求見獻寶的車輛排到裏許外，王鎮惡忙得腳打後腦跟，痛並快樂着。
後秦雖滅，餘孽尚存，要穩定住局面得等到六月麥收之後，百姓手中有了喫食纔會安穩下來，屆時推行仁政、減免稅賦，吸附部落來投，通過儒學、戲曲等文化的手段增強凝聚力。要做的事很多，楊安玄腦中泛起“任重道遠”四個字。
姚泓歸降後，楊安玄讓他發出詔書，命令秦國境內的城池歸降，有不少縣城接詔後歸降，也有人據城而守，誓死不降。
殘存的最大三股勢力分別是陳倉一帶的姚恢、姚諶；池陽一帶的姚讚、姚益男；河東郡的姚懿，這三股勢力不滅，楊安玄不能安心回師。
河東郡的姚懿所佔地盤最大，但北魏長孫嵩南攻被阻，得知長安城破後秦已亡，命駐軍溫縣的安平公乙旃眷攻取河東郡東垣，待長孫嵩率一萬六千兵馬匯合後，繼續西進取安邑城北的聞喜，從東、北兩面合圍安邑城(河東郡治所，今山西夏縣西北、運城東北)。
姚成都率軍出戰，兵敗，據城而守。姚懿命姚成都之弟姚和都守猗氏城，自己以蒲坂爲國都，發動百姓抗擊魏軍，沒人響應。
諜報送到楊安玄手中，看來蒲坂秦軍殘餘先不用忙着對付。楊安玄的視線從河東郡暫時挪開，投向長安城北的池陽城(今涇陽和三原一帶)。
池陽離長安城不過百餘里，不過姚讚、姚益男的率兵馬不過一萬二千人，無力南下，等自己平定陳倉之後再率軍前去剿滅。
陳倉的姚恢、姚諶麾下有近二萬兵馬，這些將士常年與諸涼作戰，皆是精銳，不好對付，而且西秦的乞伏熾磐率軍相幫，姚恢駐陳倉東北的雍縣、姚諶駐陳倉城，乞伏熾磐則鎮守在故道城，將孟龍符攔在故道城之南。
故道城，乞伏熾磐得知晉軍從東而至，憂心不已。長安城外兩萬大夏軍被一場大火燒得狼狽逃竄的消息早在城中傳開，乞伏熾磐還得知秦軍在鴻門也被一場大火燒得死傷殆盡，姚泓才逼得投降。
西秦兵與孟龍符所率的晉軍交戰過數場，那戰車爲壁、鐵弩爲矢、狼筅爲翼的戰法讓乞伏熾磐頭痛不已，即便是短兵相接自家兒郎手中的兵器也遠不如晉軍鋒利，掌握瞭如此多利器的晉軍如何爲敵，乞伏熾磐早生退意。
平東將軍王松壽進堂稟道：“大王，晉人前來下書。”
看罷楊安玄的信，乞伏熾磐將楊安玄的信傳閱左右。安北將軍烏地延道：“晉軍滅秦之威前來，又有堅兵利器，誠不可敵。不如照信中所說，向晉廷稱臣，退回枹罕，保全將士性命。”
龍驤將軍乞伏智達道：“不戰而退、向晉人稱臣豈不讓天下人恥笑，說我等畏晉軍如虎，有損我軍銳氣。”
王松壽道：“大秦滅亡，其國土分崩離析，晉軍尚不能全部佔領，正好藉此良機開疆拓土，此許聲譽算什麼？”
乞伏熾磐道：“秦國已亡，當初姚興答應的條件大都作了廢。晉軍爲陳倉的姚恢、姚諶而來，我軍若擋在前面，喫力不討好，這仗不能打。不過，晉軍勞師遠征，奪取長安後想快速安定四方，亦擔心多樹強敵，想讓孤退軍便要向他索要些好處纔是。”
看了一眼侍在旁的弟弟乞伏曇達，乞伏熾磐道：“曇達，你去見見楊安玄，就說把故道城讓給他，讓晉軍拿刀槍來換。”
第二天已時，喬裝成牧民的乞伏曇達見到了楊安玄，把來意道明。楊安玄問道：“你家大王想要什麼東西？”
“天火”，乞伏曇達脫口道。傳說晉軍依靠這神奇的利器砸開了秦國的大門，燒掉了大夏的兩萬鐵騎，燒斷了大秦的脊樑，這簡直是神佛賜予晉軍的致命武器。
楊安玄微微一笑，搖頭道：“絕無可能。”
乞伏曇達見楊安玄態度堅決，也知道晉軍不可能將這種利器交給別人，退而求其次，說出此行真正的目的，一千件晉軍使用的刀槍。
楊安玄知道乞伏曇達所說的是棠溪所煉的刀槍，沉吟片刻道：“這種利刃我軍中亦不多，千件刀槍光憑讓出故道城可不夠。”
乞伏曇達喜道：“我家大王答應替晉軍詐開陳倉城。”
楊安玄起身笑道：“先預付二百件，等取陳倉之後剩餘的刀槍全部奉上。”
乞伏曇達大喜，從戰場上繳獲的晉國刀槍鋒利無比，大哥暗中交代他能得到五百件就算他立下大功，楊安玄許諾千件，真讓他喜出望外。
有了這些堅兵利器，己軍(西秦)將來與吐谷渾、涼國(南涼)的爭戰中就能佔據上風，擴充疆域。
五月二日，駐守故道城的秦(西秦)軍出戰，被晉軍殺敗，向陳倉潰逃。駐守陳倉的武都公姚諶不知乞伏熾磐在演戲，放其入城。西秦軍入城後控制南門和東門，放晉軍入內，陳倉城破，武都公姚諶戰死。
在楊安玄再給四百件兵器的誘引下，乞伏熾磐率軍與晉軍一起北攻雍縣。雍縣城池不高，在晉軍投石車的輪番攻擊下，難以組織起反擊。三天後沈慶之登上北城，打開城門，雍縣城破。姚恢帶着數百人從西門逃走，投奔南涼國主禿髮傉檀。
楊安玄與乞伏熾磐相會於清水河畔，相聚甚歡。楊安玄依諾交給乞伏熾磐一千四百件刀槍，乞伏熾磐派侍中翟紹前往建康遞交國書，向晉朝稱藩。
楊安玄讓朱超石率八千兵馬鎮守陳倉，與孟龍符合兵後回師長安。五月十二日，命孟龍符率軍一萬五千北上奪取池陽。
池陽城，姚讚已經收到陳倉、雍縣被奪，武都公姚諶戰死、齊公姚恢逃亡的消息，回顧麾下兵馬，雖有萬人但是皆無戰心，根本無法與晉軍相戰。
將麾下將官集中起來，姚讚道：“國破家亡，僕已決意以身殉國。晉軍來時，僕決定與之殊死一戰，諸君有願爲國盡忠者可隨僕一同前行。”
五月十五日，孟龍符率大軍逼近池陽城。姚讚打開城門，帶着百名親衛出城迎敵，身後約有千人隨行。孟龍符見秦軍衝陣，率輕騎迎敵，千餘秦軍跟着姚讚奮勇向前，包括姚讚在內盡皆戰死。
見城外戰事平息，池陽縣令馮文率人出降，投降的秦軍多達萬人。孟龍符駐軍池陽，傳檄高陸、萬年、富平等城招降，姚興男見大勢已去，率軍歸降。