在帝京之變的那一天，他沒有選擇力戰顏飛卿、蘇雲媗、玉清寧三人，而是帶着張白月逃回清微宗，開始蟄伏，因爲李玄都沒有墜境，也保存了大部分勢力，所以四先生黨沒有分崩離析。當李道虛決意立李元嬰爲宗主時，李玄都聯手張海石等人，在宗內私下串聯，使得羣情激奮，衆意洶洶，讓老宗主不得不退讓一步，改爲比劍爭奪宗主。
李玄都在蟄伏的這些年來，苦心練劍，早已暗中踏足天人境界，於是在比劍中一舉擊殺李元嬰，不僅順理成章地成爲清微宗的宗主，而且還強佔了谷玉笙。
接下來的李玄都一路順遂，境界突飛猛進，先是結識了來齊州探望秦道方的秦素，一通花言巧語之下，得了秦素的芳心。又敗顏飛卿，強奪蘇雲媗；爲了玉清寧打上玄女宗，逼得蕭時雨不得不同意他和玉清寧的婚事；再後來，遇到牝女宗的美人宮官，毫不客氣地笑納；被陰陽宗的美人上官莞暗算，他輕易化解，又施展手段，讓上官莞爲之傾心。除了這些，還有陸雁冰、周淑寧、蘇雲姣、沈霜眉、柳玉霜、錢玉樓、錢玉蓉、李非煙，以及那個把他打進城牆中的帷帽女子，全部收入囊中。
除了各色美人，李玄都還有許多屬下，皆是欽佩於他的英雄氣度，任憑驅使，除了原本就支持他的李如是、張海石等人，還有寧憶、李太一、秦襄、錢玉龍、唐秦、沈元齋、錢青白、沈元舟、趙良庚等人，青陽教被他收服，錢家是他的馬前卒，荊楚總督、齊州總督、江南總督三大總督都是他的提線木偶，他又通過秦素，掌控遼東五宗和秦家，繼而控制遼東總督趙政。
有了如此實力，李玄都智珠在握，巧妙算計佈局之下，正一宗被他打得山門緊閉，顏飛卿道心崩潰，變成廢人，大天師被算計得心境蒙塵，境界大跌，李玄都由此成爲正道盟主，繼而率領正道十二宗討伐邪道五宗，道種宗臣服，無道宗四分五裂，陰陽宗滅門，誅地師，殺藏老人，讓冷夫人爲奴做婢。
一統江湖之後，李玄都還要做皇帝，於是揮師北上，攻入帝京，太后謝雉帶領小皇帝白衣披髮捧玉璽出降，李玄都由此登上帝位，分封羣臣、妃嬪，冊封張白月爲皇后，秦素、蘇雲媗、宮官、玉清寧爲貴妃，其餘人爲妃。
做了皇帝求長生，李玄都又想做萬年不朽之帝王，僅僅一個長生境是不夠的，他還效仿祖龍之舉，派遣方士帶三千童男童女出海前往婆娑州、鳳鱗州尋仙求藥，要佔盡世間的一切好處。
這一日，是秦素侍寢，稍歇，李玄都放下了所有的警惕，沉沉睡去，就在這個時候，已經睡去的秦素緩緩睜開雙眼，悄無聲息地起身來到李玄都的旁邊，然後舉起了早已藏好的長刀。
在秦素一刀斬落的瞬間，李玄都猛地驚醒過來。
然後就聽得秦素歡聲道：“你醒啦”
剛剛在夢中被秦素殺了一次，再聽到秦素的聲音，李玄都不禁打了個寒顫，又閉上了雙眼。
秦素有些疑惑地伸手摸了摸李玄都的額頭。
李玄都再度睜眼，見秦素一雙妙目正凝視着自己，滿臉都是喜色。李玄都便欲坐起，秦素按住他：“不要起來，躺着再歇一會兒。”
李玄都沒有強求，轉頭看了眼周遭情景，發現自己正身處一個山洞之中，周圍被打掃得乾乾淨淨，自己身下則是鋪了一條錦被。
雖然秦素認識李玄都之後，越發變得像個小女子，但在這之前，她也是可以獨當一面的女子，在李玄都昏睡過去之後，她便讓秦不二從羅青青的宅子裏找了一牀乾淨的錦被，將李玄都包裹起來，然後一行人找了這處僻靜山洞避雨。
過了片刻，李玄都漸漸恢復清明，從剛纔的夢境中脫離出來，問道：“我睡了多久”
說到這兒，秦素竟是有幾分眼淚婆娑：“萬幸沒事。”
李玄都抓住她的手，笑道：“我做了個夢，在夢裏還真死了一次。”
秦素問道：“什麼夢”
李玄都想了想，沒敢如實相告，只能含糊其辭：“在夢裏，我好像變成了另外一個人，行事特別霸道，就像是宋政一樣。”
秦素扁扁嘴道：“宋政，行事不擇手段，貪慕權勢，還特別好色，見到好看的女子就要招惹，就要收爲自己的禁臠。可他這個人的確有本事，長得也好看，又慣會哄女孩子，所以許多女子都被他矇騙。我是頂討厭這種人的。”
李玄都乾咳一聲：“差不多就是這麼個意思。”
秦素望着他：“那你在夢裏都招惹了哪些女子”
李玄都有點後悔自己沒事提這個做什麼，這不是自己挖坑自己跳嗎不過開弓沒有回頭箭，他只能硬着頭皮說道：“夢裏的事情，做不得數的，夢裏那個人，根本就不是我。”
秦素不置可否，問道：“然後呢”
李玄都只能如實說道：“在夢裏，我的確招惹了很多女子，然後就被你一刀殺了。”
秦素“啊”的一聲，驚叫了出來：“人家都說日有所思夜有所夢，難道你心底就這麼想的在你心裏，我就是個這麼狠心的女子”
李玄都立刻辯解道：“夢是反的以這個夢境來看，我絕不會招惹其他女子，你也不是這麼狠心的女子。”
秦素凝視着他的雙眼，道：“玄哥哥，你這是真心話呢，還是哄我”
李玄都坦然道：“我若心虛，又如何會主動提及此事”
秦素低下頭，輕聲道：“對不起，玄哥哥，我不是信不過你，只是忍不住會害怕你修煉了陰陽宗的太陰十三劍，我聽爹爹說起過，凡是修煉到最後的人，即使不淪爲劍奴傀儡，也會性情大變，我真怕你有一天突然就變了性子，不再關心天下蒼生，也不再在意我，就像宋政一樣，只關心江山美人，或是隻關心長生大道，就像你做的這個夢，那樣的李玄都，還是我熟悉的李玄都嗎”
秦素這番話卻是提醒了李玄都，自從他服用了“五毒真丹”之後，便壓制了“太陰十三劍”的種種反噬，隨着他的境界不斷恢復提升，一覺“太陰十三劍”作怪，便立時將之鎮壓，已是許久沒有遇過兇險，但這一次他消耗甚巨，壓制體內“太陰十三劍”的力度便相應減弱，心魔叢生，於是就有了這個古怪夢境。
想到這兒，李玄都忍不住坐起身來，伸手抱了下秦素。
秦素被他抱住，頓時臉色羞紅，想要推開他，卻又念在他剛剛醒來，有些不忍。
好在李玄都很快就鬆開她，笑道：“好素素，你卻是提醒了我，我自修爲有成以來，入睡很淺，又沒有宿命通這等預知手段，已經久不做夢，所以這個夢很是蹊蹺，多半就是太陰十三劍的心魔之故了。”
秦素忍不住驚呼一聲。
李玄都握住她的手，安慰道：“你不要害怕，咱們兩個還不認識的時候，太陰十三劍的反噬可比現在兇狠多了，我還不是熬過來了只要知道了問題所在，總有辦法解決的。”
秦素雖然稍稍安心，但還是嘆了口氣：“我若早些認識你就好了，我寧可拼着被爹爹責罰，也要把天問九式教給你，免得你再去學這些邪魔外道的招數。”
李玄都感念她的好意，開解她道：“我本就是練劍之人，得窺三大劍訣，於劍道一途，卻是沒什麼遺憾了。正所謂福禍相依，只要我能化解太陰十三劍的反噬，也算是壞事變好事了。”