1560年，腓力二世以英國背叛天主教爲由，以各種手段干涉英國內政，甚至意圖左右英王的人選。與此同時，因新加冕的英王伊麗莎白一世大力推行和發展新教，更是激起了羅馬教宗的不滿，甚至一度宣稱伊麗莎白一世的英國國王之位是非法的。
英國在大力發展新教的同時，也在同步對外輸出新教，目標即爲荷蘭尼德蘭。荷蘭原本一直處於西班牙的控制之下腓力二世的父親查理五世通過繼承得來，是後者重要的稅賦來源地。但自1581年開始，荷蘭就宣佈脫離西班牙的控制，進而成立尼德蘭聯省共和國。
本質上來說，腓力二世干涉英國有一定的法理基礎，即他是英國前女王的丈夫，是當時英格蘭王國的共治國王儘管他並不長期呆在英國，瑪麗在世時他也不愛搭理英國事務。但英國在伊麗莎白一世繼位後向尼德蘭地區輸入新教，則實在毫無法理依據，的確可以稱得上腓力二世所說的背叛天主教了。
而且，西班牙和尼德蘭之間的事務從某種意義上來說，應當算得上是“內政”。英國對本就信仰天主教的荷蘭輸出新教，當然會激化與西班牙之間的矛盾。久而久之，英國和尼德蘭的關係愈發密切，同時與西班牙的關係則越來越糟糕，也就不奇怪了。
在這期間還發生了一件大事，伊麗莎白的表侄女蘇格蘭女王瑪麗一世不是腓力二世的老婆那個瑪麗一世因信仰天主教，被腓力二世與天主教會認定是正統英國女王。
1567年，瑪麗因貴族叛變而遭到囚禁，並被迫將蘇格蘭王位讓給她的幼子詹姆斯。驚險逃脫後，她迅速逃往英格蘭，卻又被姑姑伊麗莎白囚禁。此後直至瑪麗過世的二十年間，伊麗莎白與詹姆斯的敵對者仍然不停地籌劃將瑪麗推上英蘇二國女王的寶座。
而利益方面的衝突也日益嚴峻，英國在西班牙大陸、美洲及大西洋的私掠行爲西班牙視其爲海盜嚴重影響西班牙的王室收入。
英國的跨大西洋奴隸貿易——由約翰·霍金斯爵士於1562年發起——獲得伊麗莎白的支持，其無視西班牙政府控訴霍金斯在加勒比地區西屬殖民地的貿易實已構成走私，更是讓西班牙對英國視如仇寇。
1568年9月，一支由霍金斯與法蘭西斯·德雷克爵士領導的奴隸買賣遠征隊遭到西班牙突擊，造成數艘船艦於墨西哥韋拉克魯斯沉船，即聖胡安戰役。
這場交戰使英西二國關係迅速惡化，翌年英國便扣押了數艘西班牙派遣至荷蘭支援軍隊的珍寶艦隊。德雷克與霍金斯則加強私掠以突破西班牙在大西洋貿易的壟斷。
爲達成宣揚新教的人生宗旨，伊麗莎白提供法國宗教戰爭與荷蘭革命的新教勢力援助、對抗西班牙。與此同時，腓力二世則大力壓制新教的傳播，資助法國戰爭的天主教聯盟、支持愛爾蘭的第二次德斯蒙德戰爭1579年－1583年，擁護愛爾蘭天主教徒反抗伊麗莎白。
1585年，伊麗莎白與荷蘭簽訂楠薩奇條約，同意供予人力、馬匹與津貼。腓力二世將此視爲伊麗莎白對西班牙的宣戰。
戰爭實際上於1585年就已經爆發。德雷克駛往西印度羣島，在聖多明哥、卡塔赫納、佛羅里達州的聖奧古斯丁進行劫掠。英國投入了這場後世被稱爲“八十年戰爭”的戰爭之中，站在早先宣佈脫離西班牙統治而獨立的荷蘭新教聯邦即尼德蘭聯邦一方。
腓力二世決議入侵英國，但1587年4月德雷克炸燬37艘在加的斯港口的西班牙船艦後，入侵計劃隨之受阻。
同年2月8日，伊麗莎白一世處決蘇格蘭女王瑪麗一世，觸怒了歐洲的天主教徒。她的英國王權指蘇格蘭女王瑪麗一世按照她的個人意願，傳交予腓力二世——簡單粗略的說，也就是表侄女把自己繼承英國女王的權力讓渡給了姑父。
7月29日，腓力二世獲得教宗認同，推翻伊麗莎白一世在英國的統治；同時，教宗庇護五世下達破滅令，將伊麗莎白逐出教會，並安排任意人選接掌英國王權。
既然擺出了宗教因素，席爾瓦司令只好先順着他的話道：“沒錯，我認可你的判斷，也讚賞你的虔誠……可是，這與我們要不要打敗面前這艘中國戰艦又有什麼關係呢？”
“司令官閣下，馬尼拉大帆船貿易之所以存在，是因爲它能爲王國帶來利益，對於這一點，想必您一定是明確瞭解的。”埃切瓦里稍稍一頓，繼續道：“那麼既然如此，我們作爲王國海軍的一員，就需要時時刻刻站在王國的利益上考慮行動。
比如說對方這艘船，雖然我也很詫異它爲何表現得如此怪異，畢竟我們過去這些年從來沒有與他們發生過海上衝突——除了您知道的那一次之外。但是，既然現在它有這樣的舉動，那麼我們稍作迴應，將其逼退是說得過去的，但倘若真的形成戰鬥，我認爲並不符合王國的利益。”
“你是擔心中國人因此不來菲律賓與我們進行貿易了嗎？”席爾瓦搖頭道：“我認爲不會。中國人對白銀的渴求遠遠超過了我們此前的預計，我不認爲他們會因爲一次小小的戰鬥就放棄這麼多白銀。”
“您說得沒錯，司令官閣下，中國人對白銀的渴求的確讓人驚訝，但在我看來，恐怕還是我們對他們的需求更多。”
埃切瓦里嘆了口氣，道：“貿易額、利潤這些東西您已經很熟悉了，無須我來重複說明。我想說的是，王國對英格蘭的戰爭恐怕並非一時半會兒就能決出勝負的——我是指，即便無敵艦隊擊敗了英格蘭人，陸軍登陸英格蘭本土，這場仗也遠遠沒有我們想象中那麼簡單。”
“英國人在百年戰爭中就已經表現出了驚人的韌性，而我在出發前獲悉，我們的無敵艦隊雖然足夠龐大，但其實所載的陸軍士兵只有8000人，加上可以下船進行陸戰的水手，也最多不會超過兩萬。
英格蘭人會被兩萬人打敗嗎？他們也許會喫一些苦頭，但恕我直言，要靠着不到兩萬人使英格蘭屈服，恐怕並不容易。”
席爾瓦皺眉道：“我們可以加派援軍。”
“錢從哪來呢？”埃切瓦里一攤手：“現在王國的財政狀況您還不知道麼？這次出征要不是教宗陛下慷慨地恩賜，特許我們可以從卡斯蒂利亞的教產中徵收那筆戰爭稅的話，現在恐怕都根本出不了兵。而即便如此，國王陛下依舊再次欠了熱那亞一大筆錢。”
席爾瓦有些不耐煩地道：“所以，您認爲現在我們比中國人更缺錢，因此即便他們如此挑釁西班牙海軍，我們依舊要忍氣吞聲，只爲了不影響這一年近千萬兩比索的利潤？哦，對了，王室在其中抽稅20%，所以實際上國王陛下能拿到的只是兩百萬比索。”
“兩百萬比索還少嗎？”埃切瓦里苦苦相勸：“國王陛下或許不怕損失兩百萬比索，但我想，即便富有四海，他也不願意損失一個一年就能創造兩百萬比索財富的長期生意。”
席爾瓦長長地吐出一口濁氣，無奈道：“好吧，好吧，埃切瓦里艦長，你說服我了，我決定……”
“砰！”
“砰！砰！砰！砰！砰！”
一連串的炮聲打斷了席爾瓦司令的話，他先是一怔，繼而大怒吼道：“怎麼回事？還沒到射程之內，是誰開了炮？”
從外頭跑進來的大副回答他的話，讓他和埃切瓦里同時呆住了：“報告，司令官閣下，是中國戰艦搶先開炮校射了！”
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