軍械糧草方面我們也已竭盡全力，但即便如此仍憂不足，何況數萬百姓每日也需照料供應。明日倭寇攻城之後，諸位各居本位，戰法只能隨機應變。”
倡義使金千隘問道：“現今大家都是同仇敵愾，數萬百姓也可化身義兵，如此比較卻也不差他多少。晉州能守一次，就能守第二次，實在不行也無非以身殉國，與倭寇戰至最後一刻罷了。只是倭寇畢竟太多，且又久歷大戰……不知明軍和朝廷是否會來救援？”
金海府使李宗仁答道：“據我所知，朝廷還都王京不久，各道剩餘兵力至今統計不全，除守衛王京的軍隊外，現在身在晉州的恐怕就只有我們了。
哦對了，還有權慄和李穦還在南原一帶，不過他二位兵敗方退，一時間應無法支援。而且聽聞朝廷中不少將領都認爲晉州此次必將失陷而反對救援。柳成龍都體察使已經去向明軍求救，卻不知明軍此次是否還會來？”
朝鮮朝廷和大明援軍之間的關係現在十分微妙，這一點他們作爲一線將領當然都是清楚的。總體上來說就是朝鮮始終希望保持獨立性，但明軍方面卻一直認爲朝鮮不具備獨立作戰的能力，要求朝鮮軍一方面必須服從明軍指揮，另一方面還不能老給明軍找麻煩。
這種局面就好比明軍認爲自己是下棋的棋手，而朝鮮只能作爲棋子，決不允許朝鮮如之前一樣明明身爲棋子，卻反而想方設法拉明軍去打他們認爲當時不該打的仗。
朝鮮當然不能認可這種局面，覺得自己被明軍視爲拖油瓶甚至炮灰，自尊心受到嚴重打擊，於是雙方鬧僵，變得各幹各的，失去了“聯軍”應有的和諧。
本來從雙方的宗藩關係而言，明軍理論上自然應該行使指揮權。可是單從雙方兵力而言，明軍只出動了五萬左右，而朝鮮雖然連喫敗仗，正規官軍仍然有十萬左右，兩倍於明軍。至於朝鮮的各種義軍、僧兵之類一旦也加入計數，那麼這個數量差就更大了。
拳頭大小就是聲音大小，雖然到目前爲止聯軍的勝利絕大部分是數量更少的明軍取得，但基於以上總兵力緣故，明軍也很難強壓朝鮮各方的呼聲，於是這種指揮權的僵持一時間就看不到打破的希望，這纔有了他這句“卻不知明軍此次是否還會來”。
忠清道兵使黃進對此提議：“倭寇已兵臨城下，援軍能來最好，若是不能來，那也只能依靠我們自己，但對軍中及百姓還是需告知援軍將至，以免之後士氣懈怠。
我以爲只要晉州城牆尚在，晉州便絕不會失陷。只要撐過幾日，援軍應該還是會趕來的。對了，守城之時要多注意身着奇特盔甲者，因爲倭軍將領盔甲各異，並非制式。若能每次對倭軍將來予以擊殺，必能有效逼退倭寇而減少我軍傷亡。”
義兵首領高從厚起身立誓道：“我父兄死於倭軍之手，我今領義兵也是決意爲父兄報仇，倭將小早川隆景不知是否就在城外，我立誓每日至少必射殺一將，總能將其揪出。我所領義兵也都是父兄舊部，此次共守晉州，我軍必將寸步不退，不死不休。”
圍城次日，日軍首批部隊攻城開始展開。此時朝鮮早已引南江之水灌入護城河中，這護城河寬約丈餘，日軍難以輕進。宇喜多秀家下令日軍開掘堤壩，引走江水。
隨後日軍用土塊、草垛填平護城河，頂着竹盾向晉州城牆逼近，朝軍弓弩幾乎毫無效用。日軍在竹盾掩護之下於城角挖掘地道。
可惜日軍挖掘地道的手法有些低劣，正挖着挖着，牆角忽然塌陷，壓垮了地道，反而自行損失了部分士兵。朝鮮方面也沒幹看着，李宗仁下令朝軍趁機潑下熱油，並同時以火矢助燃，一時間城外火勢大作，日軍不得已只好退卻。
片刻之後，日軍第二批次開始強攻登城，朝軍仍然拼死抵抗。兩軍之間就如此拉鋸了整整三天，日軍攻城已不下十次，朝鮮軍身心俱疲。金千隘率一隊朝鮮軍日夜準備軍糧，逐個遞送，鼓舞士氣，此時城外早已死屍遍地，日軍居多，朝鮮軍也有不少。
面對這種僵持局面，黑田長政獻計道：“或可於城東修築多處高壘，居高臨下突入城中，避開蟻附攀城之血戰，減少我軍傷亡。”
石田三成對這個計劃頗爲懷疑，認爲朝鮮軍方面雖然在火繩槍上處於劣勢，但卻擁有一些中小型火炮，以及部分疑似由明軍提供的其他火器，如一窩蜂、震天雷等，在這些遠程火器面前堆建高壘能成功嗎？
黑田長政的回答也很光棍，他說道：“無論成與不成，眼下如此血戰也非上策，我這建議只是爲了儘量減免我軍傷亡，倘若此計不成，那就再另做謀劃便是。而且，加藤清正的傑作龜甲車即將完善，如若兩日之內我軍仍不能攻破晉州，便只好請加藤將此車投入作戰了。”
說了半天，原來是沒辦法下的辦法，不說是病急亂投醫吧，至少也是隨便試試看了。宇喜多秀家聽了也覺得與其毫無應對，倒真不如試一試效果，也就表示了同意。
於是到了第五日，日軍開始於城東築高壘，準備乘高躍入城中，朝鮮軍民果然也爭鋒相對，自己同樣築壘不說，還不斷以火炮轟擊日軍壘頂。
日軍火繩槍列陣野戰雖然佔優，但在這種時候硬拼射程卻不如朝鮮軍手裏的火炮，捱了幾頓亂轟之後承受不住了，最後只得放棄。
到了第六日，晉州城內箭、石都即將耗盡，金千隘、崔慶會、高從厚、李宗仁、黃進等人引領軍民持續與日軍撕殺，兩軍激戰直至次日天明。
第七日，加藤清正下令所部日軍將十輛新造好的龜甲車投入戰鬥，這龜甲車其實是受朝鮮龜甲船啓發而造，加藤清正在攻城衝車上加蓋數層厚板，整體強度堅固耐用，構造也算精巧，打磨更是精細，可檔落石弓弩能用於衝擊城門、城牆，日軍也能借此助力登城，只是這東西太大了，行動起來笨拙緩慢。
崔慶會見此龜甲車雖然巨大，但卻全爲木質建造，二話不說便下令向龜甲車澆灌火油，然後射出火箭引燃，很快的時間之內便焚燬數輛。
加藤清正大喫一驚，急令將全部龜甲車撤回，然後乖乖模仿起中國曆代攻城車的做法，在龜甲車外包上牛皮以防火燒，同時再次加緊趕造，運至各隊。