第一令雲：“元洪於本月七日就大總統任，自維德薄，良用兢兢。惟有遵守法律，鞏固共和，造成法治之國。官吏士庶，尚其共體茲意，協力同心，匡所不逮，有厚望焉！”
第二令雲：“現在時局顛危，本大總統驟膺重任，凡百政務，端資佐理，所有京外文武官吏，應仍舊供職，共濟時艱，勿得稍存諉卸。此令！”
第三令雲：“民國肇興，由於辛亥之役，前大總統贊成共和，奠定大局，苦心擘劃，昕夕勤勞，天不假年，遘疾長逝。追懷首績，薄海同悲。本大總統患難周旋，尤深痛愴。所有喪葬典禮，應由國務院轉飭辦理人員參酌中外典章，詳加擬議，務極優隆，用副國家崇德報功之至意！”
黎元洪雖然做了總統，可是他自己沒有實力。當時的中國，最有實力當屬北洋系，其次要屬國民黨，而黎既非北洋系，又不屬國民黨。
在北洋諸帥看來，黎不值得他們的擁戴；在國民黨人看來，黎在二次革命後投靠袁以自保，不是真正革命黨人。
可是黎元洪也有他的獨特優勢，因爲他不屬於任何一方，又是現任副總統，反而能被各方所接受。
但是，未必有人真的拿他這個總統當回事，所以黎元洪的處境是尷尬又艱難。
黎元洪就職後，國人便對《約法》的執行引起爭議。《約法》有兩個，執行哪一個？是新《約法》呢？還是舊《約法》？舊《約法》是民國元年的，新《約法》是民國三年的。
西南軍務院撫軍長唐繼堯於六月十日通電提出：
（一）請黎大總統即日宣言恢復民國元年公佈之《臨時約法》；
（二）請召集民國二年解散之國會，依法補選副總統，及要求同意任命國務員，組織正式國務院；
（三）請懲辦帝制禍首楊度、孫毓筠、嚴復、劉師培、李燮和、胡瑛、朱啓鈐、段芝貴、周自齊、梁士詒、張鎮芳、雷震春、袁乃寬等十三人；
（四）請下令召集軍事特別會議，由各省都督或將軍各派代表在上海開會，議決一切善後軍事問題。
西南軍務院副撫軍長岑春煊亦宣稱這四個條件是護國軍方面一致主張，如北京方面同意接受，撫軍院當立即撤銷。
唐、岑的通電發出後，在上海的唐紹儀、梁啓超、伍廷芳等則聯名通電呼應。國會議員谷鍾秀、孫洪伊等則在上海登報召集議員自行集會，以擁護法統，維持舊《約法》爲奮鬥的目標。
段祺瑞在黎元洪接任總統時提出的根據是新約法，自然不贊成恢復舊《約法》。
他沒徵求黎元洪意見，於六月二十二日以國務院名義通電各省：“黃陂繼任，元首得人。半月以來，舉國上下所齗齗致辯爭者，《約法》而已。然就《約法》而論，多人主張遵行元年《約法》。政.府初無成見。但此項辦法，多願命令宣佈，以期迅捷，政.府則期期以爲未可。蓋命令變更法律，爲各派法理所不容，貿然行之，後患不可勝言；是以遲徊審顧，未敢附和也。或謂三年《約法》，不得以法律論，雖以命令廢之，而無足議，此不可也！三年《約法》，履行已久，歷經依據，以爲行政之準，一語抹殺，則中國一切法令，皆將因而動搖，不惟國際條約關係自重，不容不再三審慎，而內國公債以及法庭判決，將無不可一翻前案，加之何其可也？
“或謂國人之於元年《約法》，願見之誠，幾不終日，故以命令宣佈爲速。抑知法律爭良否，不爭遲速，法而良也，稍遲何害？法不良也，則愈速恐愈無以系天下之心，天下將蜂起而議其後矣！縱令人切望治，退無後言，猶不能不慮後世爭亂之源，或且舞法爲奸，授我以資爲先例，是千秋萬世，猶爲國史增一汗痕，決非政.府所敢出也。總之，復行元年《約法》，政.府初無成見，所審度者，復行之辦法耳！諸君子有何良策，尚祈無吝教言，俾資考鏡。”
唐紹儀、梁啓超、伍廷芳等則致電駁復，詞意堅決：“如此次我大總統依法繼任，政.府對內對外，迭經聲明，所依何法？非根據元年《約法》規定程序所衍生之大總統選舉法耶？使三年《約法》而爲法也，一法不容二存，則被該法所廢止之《大總統選舉法》，定當非法，云何能依？果爾，則何不於六月九日，開所謂石室金匱以別求元首？夫我總統正位，而國內外共仰爲合法者，無他焉，以三年《約法》之不成爲法也。又如我公今所長之機關爲國務院，國務院者，元年《約法》上之機關，三年《約法》所未嘗有也。三年《約法》若爲法，元年《約法》定非法，公所長之院何由成立？今發佈院令而中外共許爲合法者，無他焉，以三年《約法》之不成法也。揆諸法理如彼，徵諸事實如此，則三年《約法》之非法，確成鐵案。”
唐紹儀、梁啓超、伍廷芳等的電文，一語中的。如果按袁氏《約法》，現在的國務院都是非法的，何論其他。
其實，段祺瑞不會不知道，新約法突出的是總統的權力，這恐怕是他也是不能接受的。但段祺瑞實在是不想恢復舊《約法》和國會，於是想效法袁世凱，搞個約法會議，來修訂一個新約法。
這麼大的事段祺瑞不與自己這個大總統通氣，就自作主張，黎元洪索性作壁上觀。
舊《約法》和國會是辛亥的主要成果，是民主共和的基石，在革命黨人和有識之士看來，不恢復舊《約法》和國會，就不可能重造共和。
六月二十五日，發生了一件大事。駐滬海軍總司令李鼎新、第一艦隊司令林葆懌、練習艦隊司令曾兆麟發表聯合宣言，爲捍衛舊《約法》、捍衛共和，上海海軍宣告獨立。