由於這是共和後的第一次競選，爲防止一些暴力、恐怖、復辟分子乘機搗亂，爲了使選舉順利進行，**出動了軍警和便衣，對衆議院進行保護，這似乎也是無可指責的。
只是，後邊發生的事情，實在是不可理喻。
按新公佈的《總統選舉法》，總統競選以選舉人總數的三分之二以上出席，方爲有效。用無記名投票行之，得票滿投票四分之三者當選。當連續兩次投票無人獲四分之三選票當選時，第三次選舉，就以第二次得票較多者二人選之，再以得票過投票人之半數者爲當選。
此次到會議員七百五十九人，超過了法定的人數，選舉有效。
共有四位候選人蔘加競選，他們是袁世凱、黎元洪、孫中山、伍廷芳。
第一輪袁世凱得四百七十一票，黎元洪得一百五十四票，而孫中山和伍廷芳只得了幾票。儘管四人人都沒有達到四分之三的票數，但是第一輪投票，袁世凱得票離四分之三已經很接近，而孫中山則只得了幾票。
在一個國民黨爲第一大黨的議會里，絕大多數的國民黨議員都投了袁世凱票，足以證明袁世凱在當時威望之高。
四個候選人均爲未達到法定的四分之三多數，按《總統選舉法》，需要再進行一次投票。
當袁世凱沒有當選的消息傳來後，那些身穿便裝，軍靴，軍褲，短槍都露在明處，明眼人一看就知道是幹什麼的“公民團”。?整齊嚴肅地大踏步進入會場，將正在投票的議員們裏三層外三層地圍了個水泄不通，圈內之人就算插翅也難飛。
議員們本來想去喫飯，但是看見外面這個架勢，瞬間都慫了，乖乖坐回了議會庭繼續討論。
議員們何時見過這等“民主”架勢，只得推議長去交涉，要求這些人退出會場，不得干涉選舉。
誰知那幫人聽後，反而大聲嚷嚷起來：“我們都是公民團，今日推選大總統，關係重大。倘若你們選出辜負衆望的大總統，我們是不答應的！我們醜話說在前頭，要是所選非人，今天各位就甭想走出會場！”
如此情形，議員們也就明白了七八分。
很多議員是第一次參加投票選舉，沒搞清楚投票規則，造成了首次投票中出現了不少的無效票。那些無效票大多都是投袁世凱，也就是說，如果這些無效票都有效的話，第一次投票袁世凱得票應該是可以達到四分之三的。
第二次投票幾乎沒有了無效票，按說袁世凱這一次是可以順利通過的，但是沒有。
不能不讓人敬佩的是，當時那些議員們還是頗有些骨氣的。在如此高壓下，他們偏不肯將票投給袁世凱。第二次投票，袁世凱雖然有所增加，但也只是得了四百九十七票。距七百五十九人的四分之三的五百六十九票，還差七十二票。孫中山和伍廷芳基本無變化，黎元洪到是多得了一些票。
從效果上來看，“公民團”的做法其實是添亂。黎元洪多得的票很可能就是國民黨議員投的，雖然他們未必打心眼裏支持黎元洪。
無記名投票，也叫祕密投票，總不能拿着槍看着人家寫票。
由於大家對當時投票流程不甚熟悉，從**、填票、投票、開票、唱票，這一圈搞下來大約要四個小時，議員們的肚皮也有些餓了，打算明日再進行第三次選舉。
但是，這些“公民團”們堅決不答應，他們早已將會場團團圍住，許進不許出。就連四面圍牆也站滿了軍警，不選出“袁總統”，誰也別想跳出這禁錮圈。
時間拖到晚上，議員們餓得急了，想闖出大門找點喫的，但那也不行。議員們還沒等走到門口，便被“公民團”的人拽住，輕則破口大罵，重則飽以老拳。把議員們打得抱頭鼠竄，狼狽地逃回會場。
最可笑的是，某些議員好吸大煙，一時間煙癮犯了也沒法補充。這羣人在會場上哈欠連天，鼻涕不是鼻涕，眼淚不是眼淚，真是急得抓耳撓腮，捶胸頓足，徒然讓“公民團”取笑。
也有送飯的。比如支持袁世凱的公民黨給他們的議員送飯來了，“公民團”的人便放他們長驅直入。
進步黨也派人來送喫的，但這些凶神惡煞的“公民團”們不讓他們隨便進去。
進步黨的人急忙說：“我們是擁護袁總統的！”
“公民團”們聽了喜笑顏開，大手一揮，說：“那就趕緊進去吧！”
國民黨派人送飯來，說：“我們是國民黨的，給議員們送飯！”
“公民團”們大怒，罵道：“國民黨的不準進，多餓死他幾個纔好，活該！”
眼看不繼續選舉就不許出門，議員們也只好忍氣吞聲地接着進行第三次投票。
錢面說過，按照《大總統選舉法》第二條：“兩次投票無人當選時，就第二次得票較多者二名決選之，以得票過投票人數之半者當選。”換言之，這次只在袁世凱和黎元洪中間選舉一人，而且只要過半數就可當選。
待到選票發到各議員的手中，“公民團”們又叫嚷起來了：“選舉袁總統！”“誰不選袁總統就別想出門！”“誰不選袁總統就別想喫飯！”
在此喧囂聲浪下，飢腸轆轆的國民黨議員們早已是手腳發軟，頭昏眼花。但即便是這樣，仍舊有部分硬骨頭議員在選票上畫叉，以示抗議。
投票結果袁世凱得五百零七票，遠遠超過半數當選總統。
當主席宣佈投票結果，袁世凱當選爲中華民國的第一屆大總統時，全場的人還是很振奮的。
人們有理由爲中國兩千年來的第一位選舉總統而高興，不管是國民黨，還是共和黨、民主黨、統一黨、甚至一些小政黨，各位議員們不分政見如何不同，他們第一次用投票的方式決定了一個國家的最高領導。