面對“粲麗盈目”的寶物，北府軍將士瘋狂爭搶，孫恩率部由曹娥江口逃歸海島。
謝氏族人爲了報仇，大規模搜索孫恩餘黨，追討、手刃馮嗣之等人。官軍到處，軍紀蕩然無存，劉牢之等人放縱軍兵燒殺搶掠，士民無不失望，殘餘的百姓紛紛避入山中。三吳郡縣，一片荒涼，百里不見人蹤。
孫恩敗退，司馬元顯以徐州刺史謝琰爲會稽內史，督五郡軍事，率徐州文武官員，分北府軍萬人，坐鎮會稽，劉牢之部將桓寶被留在三吳。
劉牢之領剩下的北府軍迴歸京口，劉敬宣向其父表劉裕之功。劉牢之向朝庭請功，劉裕升爲四品廣武將軍，在北府軍中統領兩千兵馬。
…………
皇甫敷兵敗盤龍山，帶着殘兵敗將退守襄陽城，清點殘軍不足二千人。
接到皇甫敷的急報後桓玄大驚失色，不過此時他亦無法抽調大量兵馬剿滅盤龍山，因爲接收荊州並不順利。
桓玄兵臨江陵城，殷仲堪和家人倉惶出逃，荊州文武唯有羅企生一人相隨。羅企生之母，胡藩之姑也。
馮該抓住殷仲堪，羅企生亦在其中。羅企生在荊州頗有清名，桓玄與他交好，於是派使者勸說其認罪，可免一死。
羅企生不肯屈服，桓玄大怒，斬殺羅企生。臨刑前羅企生道：“文帝寫嵇康，其子嵇紹爲晉之忠臣。愚請桓公留愚弟奉養老母。”
桓玄感嘆，依言饒恕了其弟羅遵生。桓玄曾送給羅企生之母胡氏一領皮袍，胡氏在豫章聞子被害，當即將皮袍燒了。
哪料佔據江陵後，士族雖然前來拜見，但並未像桓玄想像中的那樣熱情。
長史卞範之見桓玄一臉鬱悶，勸說道：“殷仲堪在荊州善取人情，邀買人心。此次主公雖然趁天災取荊州，殷仲堪因爲賑災而無糧，所以荊州人才會對主公不滿。”
羅企生被殺之後，荊州士族“衆鹹悼焉”，兔死狐悲，物傷其類。
這讓桓玄整頓荊州變得越發艱難，只得將兵馬分散鎮守各郡，以防動亂。
桓玄向朝庭請任荊、江兩州刺史事被駁回，緊接着三吳動亂。桓玄笑看戰亂，準備等朝局不可收拾時揮軍東向，主政朝堂。
朝庭並沒有調動豫州兵馬平叛，而是讓北府軍南下，三吳局勢急轉直下，司馬尚之屯兵歷陽威脅潯陽，桓玄只得派馮該率軍駐守。
這樣一來，桓玄雖然有三萬多兵馬卻被分散於各處，只能勉強抽調出二千人派往襄陽，這點人手已無力攻打駐守南陽宛城的楊思平，雍州暫時變得風平浪靜起來。
注(1)：李淵父諱李虎，虎疁乃改爲滸疁；五代十國時避錢鏐諱，又改名爲滸墅，明明宣德四年戶部設鈔關於此，即滸墅關鎮的由來。
(2)《資治通鑑》：劉牢之擊孫恩，引裕參軍事，使將數十人覘賊。遇賊數千人，即迎擊之，從者皆死，裕墜岸下。賊臨岸欲下，裕奮長刀仰斫殺數人，乃得登岸，仍大呼逐之，賊皆走，裕所殺傷甚衆。劉敬宣怪裕久不返，引兵尋之，見裕獨驅數千人，鹹共嘆息。因進擊賊，大破之，斬獲千餘人。