此時小早川隆景所率主力則在猛攻熊峙，熊峙防備簡陋，難以抵擋日軍鐵炮輪射衝擊，守將李湛見日軍來勢洶洶，斷定熊峙難守，便領義軍退至熊山佈防。
小早川隆景窮追不捨，李湛領義軍憑藉山地與小早川隆景軍周旋廝殺。小早川隆景既是智將，此刻見朝鮮義軍意欲利用地形優勢消耗遲滯自己進攻的鋒芒，爲避免佈陣遭朝鮮擾亂，遂令各部集合，放火燒山，迂迴殲敵，李湛等衆多義兵因此戰死。
全羅道巡察使李洸爲迷惑日軍，使其不敢輕進全州，便在必經之路遍佈火炬旗幟，令十幾隊輕騎于山間飛馳，故作疑兵。
小早川隆景軍剛經苦戰，又聽聞朝鮮權慄已擊敗高橋統增，目前已經率軍追來，因而見此疑兵不敢輕舉妄動，爲穩妥起見，他下令返回錦山。
隨後，小早川隆景打着感佩朝鮮義兵在錦山及熊山的英勇戰鬥的名義，下令收集熊山朝鮮義兵死屍集中埋葬，且親立木碑，上書：“憑弔朝鮮國之忠肝義膽”一行漢字，可見此人的確頗有謀略。
與此同時，在忠清道內，公州大儒趙憲聯合僧侶靈圭，大起義兵，抗敵衛國。
其實朝鮮自開國之後一直大力提倡儒學，認爲佛教乃欺世盜名之徒，長期予以打壓排擠，但如今國難當頭，朝廷大赦天下，也一改對佛教的態度。投奔民衆趨之若鶩，各地寺院深感當爲國難出力，庇護百姓，部分僧侶便率先募集僧兵。
如西山大師休靜在順安法興寺募得僧兵一千五百名；大弟子惟政和尚在杵城乾鳳寺募得僧兵七百；二弟子處英在全羅道募得僧兵一千；三弟子靈圭在公州甲寺募得僧兵七百等等。
至今爲止，朝鮮全國首批僧兵已達八千之衆，各地寺院也聞風而動，紛紛響應，休靜因此被朝廷冊封爲八道十六宗總都攝，統領全國僧兵。
而趙憲也不簡單，其身爲朝鮮儒學大師，在原歷史上後來有東國十八賢之稱，如今國難之際自然責無旁貸。他聽聞僧兵大起，更是急不可耐，於是帶領弟子們於公州擺下高臺，招募義兵。
趙憲號召民衆道：“家國蒙難、禽獸入侵、毀我山河、掠我土地、殺我人民、斷我根基、官軍不振、王室播遷、天下大亂。百姓流離失所，數百年社稷即將化爲烏有，數代父子經營家園早已毀於一旦。
如今，全羅道李舜臣連敗倭寇水軍，世子邸下身負艱險，於敵寇陣中穿梭慰勞，號召各地聯兵抗敵。我等儒學士子，飽讀詩書，苦學大道，值此國難之際，正當恪守禮義廉恥，忠君愛國，捨身而護天下黎民百姓。
諸位！請隨我義旗，入我義軍，驅逐倭寇，復我山河，捨身無畏，名留青史，但爲忠孝，百死不悔！”
趙憲慷慨激昂，羣情振奮，僅當日挑選之後，便募集義兵達一千一百餘人。
事後趙憲約見靈圭，感嘆道：“清州奶忠清道之重鎮，且存有大量屯糧。此前倭寇北上之時攻陷清州，曾以此作爲據點重兵把守，近聞清州倭軍已大部北調，清州城內僅剩數百倭軍獨守清州，勢單力孤。如此，若我等大集義軍，以數倍之力浴血奮戰，必能收復清州，天下震動！”
靈圭回答道：“公言極是，不過小僧以爲倭軍人數雖少，畢竟仍恃火器之利，我軍衣甲單薄，加之清州城大，若毫無章法貿然攻打清州城，或反不利我軍而徒添傷亡。小僧提議，可以聯合官軍，設下誘敵圍殲之計，如此或許較爲妥當。”
趙憲聽靈圭提議聯合官軍，卻有些心生不悅，他皺眉道：“大師有所不知，官軍無能，毫無鬥志，不然倭寇也難以如此猖狂，若我等聯手官軍，未必能享其力，卻恐反受其所累。若大師憐憫官軍，到可令其一邊觀戰，若我軍勝可讓其追擊殘寇。”
靈圭也知道官軍在各條戰線都表現不佳，既然趙憲已經勉爲其難應允官軍參加，即便只是讓他們打打順風仗，也算難得的給面子了，因此也不爭辯，只是應允下來再說。
趙憲面色稍霽，又道：“倭寇素來自大，見我義軍必不以爲意，只要能誘敵一部出城予以全殲，再壯以聲勢，倭寇必驚懼恐慌，士氣崩亂，即便持有利器也難有效用，此時我軍再攻清州，敵必難以抵禦。”
靈圭認爲有理，再次表示同意，於是朝鮮義軍及僧兵立刻行動起來。
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