危險嗎？看起來很危險，不過這其實也要看大局，畢竟日軍自登陸以來，朝鮮軍往往一觸即潰，日軍根本未遇敵手。正是在這樣的大局之下，蜂須賀家政由此對朝鮮戰力不屑一顧，雖然身邊僅留數百士兵，他也認爲足以壓制清州，並威懾周邊。
這月初一，趙憲所部一千一百人，靈圭僧兵七百人，官軍五百，合計兩千三百餘人進抵清州。由於此前趙憲已經定下計謀，因此便先令本部出五百人誘敵出城，剩餘六百義軍與七百僧兵於兩側埋伏等待號令，官軍負責追擊敗軍。應該說，這是一個極其常見的誘敵圍殲計。
蜂須賀家政見清州城外的挑釁者全是尋常百姓，一個個身無片甲，手持粗製刀槍，甚至許多人不過是拿着鋤頭、草叉、柴斧等農具，同時他們還隊列散亂，只知道在火繩槍射程之外叫罵。
蜂須賀家政冷笑連連，對手下人道：“區區數百賤民，手持農具，連足輕也稱不上，哪來的膽量敢在城外叫罵，必須全部碎屍萬段，以儆效尤！”他不是說說而已，立刻下令以一百兵卒追殺此股義軍。
義軍見一百餘名日軍攻來，便與之廝殺。顯然，義軍雖有五百之衆，但衣甲兵械畢竟不如日軍精良，加上又是無陣型亂鬥，激戰不過一刻便有近三百名義軍傷亡，戰局可謂一邊倒。
趙憲見狀忙發信號，前部後退引日軍追擊，隨後兩側伏兵突起，瞬間便將日軍合圍。這一下兵力優勢太大，日軍無法突圍，全部被義軍及僧兵斬殺。不過義軍繳獲火繩槍卻不會使用，只得先當做冷兵器隨身攜帶。
蜂須賀家政於城樓望見敵有伏兵，不禁喫驚，細數下來驚覺敵軍竟有數千之衆，由於此刻城內守兵僅剩兩百，蜂須賀家政心中無底，難免有所慌亂。
趙憲及靈圭趁勢號令僧兵、義軍全力攻城，義軍士氣高漲，呼喊響徹清州，於城下與日軍鏖戰。此刻忽然烏雲密佈，天降傾盆大雨，日軍火繩槍雖然製作精度不錯，但技術水平卻不算高，可比不得明軍前些年換裝的萬曆二式那樣擁有一定防雨水能力，因此陡然之間全部失效。不過禍兮福所倚，朝鮮方面也因大雨澆灌而無力攻城，趙憲無奈之下也只能下令撤圍。
蜂須賀家政見天降大雨，急忙跪地感謝神明護佑，但同時心知，次日一旦天晴，義軍必再攻城，到時恐怕清州不保。蜂須賀家政當機立斷，率領剩餘部卒連夜撤離清州。
到了次日清晨，義軍果然再圍清州，卻見清州早已城門大開，清州百姓四處活動。趙憲及靈圭疑惑不解，找來一名婦女詢問，方知日軍昨夜便已離去。趙憲心疑，不知是否是計，因此也不敢輕舉妄動，但官軍聞聽這一大捷，卻一馬當先直入清州，宣佈清州光復。
清州光復後，趙憲向官軍討要表功奏疏查看，誰料官軍不給。趙憲率衆強奪而看，果然奏疏中將光復清州之首功歸於官軍，並稱頌僧兵協助，卻惟獨對義兵卻隻字不提。趙憲勃然大怒，義軍因此和官軍接連爆發衝突。
靈圭只好充當和事老勸慰雙方，趙憲忿忿不平得回答道：“數千義民不懼生死與敵寇拼殺，他們隻字不提，官軍寸功未立不過先入空城，他們卻敢上報首功！
話說到這個地步，靈圭也只能徒呼奈何。從此起，公州義軍、僧兵、官軍之盟實質上已經瓦解。
到了本月中旬，趙憲接到命令，朝廷要求義軍、僧兵、官軍合力南下收復錦山。趙憲堅決反對同官軍合力，決意自領義軍收復錦山。
靈圭得知，連忙勸道：“公切不可意氣用事，貧僧想清州一戰之後，義軍僅剩七百，錦山倭將爲小早川隆景，聽聞乃倭國名將，極具謀略。此人部下兵多將勇，實力強大，且如今正佔據險要，單憑公目前兵不滿千，必是有去無回。還是遵從朝廷之令，三部合力，從長計議爲好。”
然而趙憲對官軍之厭惡已到極點，自然不依，執意單獨行動，他傲然道：“君辱臣死，既接到軍令，我當立刻奔赴錦山再作計較，即便飛蛾撲火也定收復錦山。但請恕在下絕不與宵小之徒共事。大師若也依然願意殺敵報國，便請與我同去。”
趙憲說罷，便正式與靈圭告別而去，瀟灑而決然。
另一邊，小早川隆景聽說公州趙憲領義軍數百來攻錦山，如今正夜宿城外，便對立花宗茂說道：“朝鮮義軍雖勇，但相比我軍仍就是相差懸殊，斷不敢以此等軍力於城外駐紮，我本料其或是一部疑兵。不過，這領兵者若果真是趙憲，那卻應另當別論。
我曾聽聞，趙憲爲朝鮮名儒，但生性孤僻，固執偏激，任何人都難與之長期共事，如此推斷，則此軍應是孤軍。
況且，趙憲雖深通儒學，但對軍略卻不得要領，不算難纏之敵。宗茂，你讓高橋統增領一千五百人趁夜祕密出城，繞到趙部背後，一是探查周邊有無伏兵，若確爲孤軍便伏於敵後，待明日你我親領武士出陣，前後相擊，討取敵將首級。”立花宗茂領命並立刻安排。
次日凌晨，趙憲陣中義軍大部仍在夢中，錦山城門大開，小早川隆景、立花宗茂引兵殺向趙憲，義軍哨兵慌亂。
趙憲聞聽喊殺聲起，急令全軍迎戰，但日軍主力已近在咫尺，伏兵已然殺至，義軍大亂，趙憲率衆拼命反抗，並激勵部下道：“性命唯有一次，必當轟轟烈烈，爲國爲民，殺盡倭寇！”
然而，軍心士氣固然是冷兵器時代的制勝法寶之一，但如今卻已經是冷熱兵器交替時節，而日軍不僅人多勢衆，且裝備精良，配合得當，殺傷力之巨大亦非古時可比。
趙憲之子身批啓賦戰袍，本想吸引敵軍，便於趙憲逃脫，但日軍鐵炮火力密集，趙憲之子頃刻中彈身亡。此次激戰之後，趙憲及七百義兵無一生還，而小早川隆景大勝之後，日軍則有序退回錦山。
次日，趙憲弟子率小股義軍趕至，發現遍地屍骸，便聚攏合葬。三日後，靈圭領僧兵進攻錦山，靈圭聞聽趙憲死訊，悲憤莫名，立誓要爲趙憲報仇。
靈圭領僧兵巧借山勢與日軍周旋，連戰三天三夜。僧兵驍勇，且因身份關係而信念堅定，再加上日軍多有信佛之人，對與僧兵作戰頗有顧慮，導致戰況變得有些拉鋸。