滿清政.府爲什麼被視作無能政.府？很重要的一點就是簽訂了那些如同“馬關”、“辛丑”等喪權辱國的條約。你民國取代了清廷，喪權辱國的條約照簽訂不誤，人們怎麼能不對這個民國，對袁世凱和袁政.府失望呢？
事實上，“二十一條”的簽訂不但使袁世凱和袁政.府的威望大減，而且爲後來的歷史埋下禍根。幾年後的一九一九年爆發的，震驚中外的“五四運動，其導.火.索也正是這個“二十一條”。
簽訂了“二十一條”，日本的那些狂熱的民粹主義和軍國主義者自以爲得志，自以爲佔到了大便宜，其實正是他們坑害了日本和日本人民。往遠了說， “二十一條”的簽訂，使日本在國際上聲名狼藉，引發這些人的野心進一步膨脹，發動侵略戰爭，最終的結果是使日本的國家和人民遭受深重的苦難。而就是在當時，也讓日本在中國的僑民的日子很不好過。
“二十一條”的簽訂後不久，袁世凱曾對其祕書曾叔度言道：“購地、租地，我叫他一寸地都買不到手。雜居，我叫他一走出附屬地，即遇危險。至於警察、顧問用日本人，用雖用他，月間給他幾個錢便了，顧不顧，問不問，權卻在我。我看用行政手段，可以破壞條約，用法律手段破壞不了。又其他各條，我都有破壞之法”。
此舉效果如何，曾任袁祕書的曾叔度在憶及此事時引日人言：“我等被囚禁於附屬地界內，一步不敢出附屬地”。“我等名爲顧問，其實絕無人顧，絕無人問。”
“二十一條”的簽訂，加之日本對中國的侵略戰爭，對兩個民族感情造成的傷痕，可以說至今還不能痊癒，這難道不是這些軍國主義者給他們的後代造的孽嗎？
如果說日本是憑實力，迫使袁**簽訂了“二十一條”，而袁世凱能取得全國的政權，爬上大總統的寶座，不同樣是憑藉實力嗎？
要是論個人的威信和魅力、論人品，這個大總統能輪上他當嗎？不說別的，就他在戊戌維新中出賣光緒帝那件事，什麼時候被提起，都會被臭出幾裏地。
毫無疑問，是北洋軍把袁世凱擡上大總統的寶座。
北洋系的基礎，建立在小站練兵時期，袁世凱手下的這些得力干將也大多來源於小站練兵。談到袁世凱的北洋軍干將，首先當屬“北洋三傑”。
這時，“北洋三傑”的情況是：馮國璋外調南京，主持長江一帶的軍事；段祺瑞在中央統理全國軍事；王士珍已退隱正定。
談到“北洋三傑”，排在首位的當然是段祺瑞。
而此時段祺瑞正以陸軍總長身份，不但對北洋軍系獨攬大權，即對於全國軍事亦有統籌之權。北洋軍的新生力量，多數是由他所培養和提拔，這一塊越來越成爲袁世凱的心病。
段祺瑞與袁世凱的其他將領不同，最大的不同是這個人有自己獨立的思想，有自己的原則。不像段芝貴等人，什麼都聽袁世凱的，總是看袁世凱的臉色行事。
論能力，袁世凱的手下無人可與段祺瑞相比。要是真有需要，把他派過去也真的頂用。但能力強，有獨立思想的人也有他們的侷限，就是不那麼聽話。比如這段祺瑞，有時候就沒有段芝貴好用。
最讓袁世凱受不了的是，段祺瑞似乎對共和情有獨鍾，三句話不過就能冒出一句：“維護共和”。更可氣的是這話袁世凱聽着刺耳，卻又找不出毛病。
不光是袁世凱對段祺瑞有諸多不滿，段祺瑞那邊，對袁世凱也大不如前了。
北洋系裏相傳有這麼一段故事：
袁稱帝以前，小站舊人早已恢復了跪拜禮，唯獨段祺瑞不肯。已經是民國了還要曲膝，他旗幟鮮明地表示反對。
袁世凱對此雖然嘴上沒說過什麼，心裏顯然是不高興的。對此，同是袁世凱左膀右臂的馮國璋看在眼裏，急在心裏。
馮國璋幾次勸段祺瑞說：“芝泉，你別任性吧，皇帝和終身總統有何區別？跪拜禮和脫帽鞠躬禮又何嘗不是一樣？”
這一次，馮拉了段一齊到袁國璋那兒去拜年，自己先跪下去，段祺瑞見馮下跪，沒有辦法，只得依樣畫葫蘆了。
袁世凱見了這兩員大將一齊跪在自己面前，倒有點不好意思，慌忙站起身來，呵着腰說：“不敢當，不敢當！”
兩個人坐了一會，再至袁克定處，也行跪拜大禮，心中當然是十二萬分委曲。怎知這位大少爺卻端坐不動，受之泰然。
馮國璋亦連連搖頭說：“芝泉，莫說你發怒，我亦忍耐不住，今後我跟着你走，我們不能再當一輩子狗了！”
馮、段的不滿，後來有人傳給袁克定，埋怨他不該擺架子激怒了北洋的兩大將。
怎知袁克定卻淡淡地說：“這正是我要的，這兩個人都是老頭子養大的，現在他們都有點尾大不掉。我若不折折他們的驕氣，將來他們更不得了，難免不爬到我的頭上呢！”
北洋軍人那一年都向袁行跪拜禮，袁在接受他們大禮時，總是喊着自己兒子的名字說：“你們快來還禮呀！”
袁克定從不答應，儼然以未來儲君自任。
這是小過節，雖使北洋系的將領對袁世凱寒心，還不是致命傷。最致命的，是他們逐漸感覺到袁世凱不肯和他們說真話，並千方百計地解除他們的兵柄。
他們覺得：“鳥還未盡而弓已藏，狡兔未死而走狗將烹！既然老頭子已不把我們當作人了，我們又何必對他忠心呢！”
在“北洋三傑”中，王士珍比較最隨和，沒有個性，因此袁世凱對其最爲放心。
民國成立後，王士珍就回到正定原籍，不問民國政治。由於袁世凱越發容不得段祺瑞，便打起了借重王士珍排擠段祺瑞的主意。
民國三年春天，袁派長子袁克定乘專車到正定去迎王士珍進京。
王士珍表示無意於再參加政治活動，袁克定說：“參不參加政治是一件事，父親邀請你去京談談又是一件事，如果你一天不啓程，我也只好留在正定促駕，無顏面回北京了。”
王士珍被大公子這麼一逼，終於情不可卻地隨同袁克定來到了北京。
袁世凱立刻頒授王士珍爲陸軍上將，並且派爲陸海軍大元帥統率辦事處坐辦。
統率辦事處是民國三年五月九日成立的，由陸軍總長、海軍總長、參謀總長及大元帥特派的高級將領組成。陸、海、參三部總長是當然辦事員，第一批所派的辦事員，只有蔭昌、王士珍、薩鎮冰三人，其後加了蔡鍔等。
這是袁世凱把全國兵權從陸軍部抓回自己手裏的一項具體措施。
自從統率辦事處成立以來，總統府的軍事處也就取消了，段祺瑞退爲辦事員之一。而陸軍部的重要職權都移轉到辦事處，陸軍部就成爲一個名存實亡的機關了。
袁世凱在宣統初奉“旨”養痾時，曾把價值三十萬元的府學衚衕私宅慷慨地贈給段祺瑞。段祺瑞從那時起便住在這所房子內，在該宅闢一個側門以與陸軍部軍需司的走廊相通，經常由這門出入。
自統率辦事處成立後，段祺瑞就不大到部議公，一切部務都交由他所寵愛的門生——陸軍次長徐樹錚代拆代行。徐樹錚是段祺瑞最親信的人，卻是袁世凱最討厭的人。
一次袁世凱表示要把徐樹錚調職，段祺瑞覺得這簡直是成心在找他的麻煩，因此沉不住氣大聲地說：“很好，請總統先免我的職，總統要怎麼辦，便怎麼辦！”
民國四年五月，正當日本提出廿一條的時候，陸軍部上了一道請求增加職員薪金的呈文，袁親筆批下：“稍有人心，當不出此！”八個大字。
由於段祺瑞不到部辦公，自然對陸軍部公事也不看，有次袁問段祺瑞某件公事，段祺瑞說不知道。
袁世凱馬上正顏厲色地質問段祺瑞： “怎麼，剛剛我看到陸軍部送來的公文，你是總長卻不知道？”
廿一條簽署後，袁克定公開向人表示：所以要向日屈服，只是因爲中國不能抗日；爲何不能抗日？因爲陸軍不能作戰，陸軍部務無人負責，因此政.府不能孤注一擲，冒險去抗日。
段祺瑞是個何等聰明之人，當然更知道進退，於是向袁世凱呈請辭職，並且不俟批准便赴西山養痾。
袁世凱當時有意拉擾蔡鍔，準備讓入京不久的蔡鍔接任陸軍總長；後來覺得這樣重要的位置不能旁落，最後還是決定留給自己的北洋的嫡系，於是陸軍總長一職便落在王士珍身上。
段祺瑞的請辭，當然是被迫的，但是他有病也是真的，所以他請辭後即赴西山養痾。而袁世凱則一再假意挽留，只准段祺瑞請假，一再給予延期，同時派王士珍代理。
北洋“三傑”中，王士珍與段祺瑞感情尤深，因爲不肯賣友，他一再堅持不肯正式就任陸軍總長。